Sofia, 15 ans, et Philip, 7 ans, ont été contraints de s'enfuir d'Amory. Ils se retrouvent maintenant plongés en pleine forêt, où ils affrontent de nombreux dangers et risquent la mort chaque jour. Alors que Sofia croit maintenant connaître toute la vérité entourant la véritable identité de ses parents, elle tente de rejoindre une amie de ces derniers, dans la partie nord de l'île, là où une mission de la plus haute importance pour la survie de l'humanité les attend, son frère et elle. Mais la rencontre fortuite des deux enfants avec Owen, un adolescent orphelin vivant dans les arbres, risque de chambouler les plans de Sofia. Qui est vraiment ce garçon ? Pourquoi veut-il à tout prix les entraîner dans une ville en ruine ? Se pourrait-il que ses intentions ne soient pas aussi bienveillantes qu'il le laisse croire ?