Nickolas Roy mène une existence monotone à l'orphelinat Saint-Anselme. Sa vie change le jour de son douzième anniversaire, quand on lui révèle qu'il est à moitié robot et que l'orphelinat abrite une agence comptant plusieurs agents secrets bioniques. Ils forment l'ASO: L'Agence des Super Orphelins. Lors d'une réunion, Nickolas et ses camarades apprennent qu'un savant du nom de Marcellus Mortemain compte zombifier la planèteentière avec une boisson énergisante de sa fabrication: SÉRÜMM. Ils devront arrêter cet homme. Ce sera leur première mission. Avec tout ça, célébrera-t-on l'anniversaire de Nickolas, alias Bio-Nick?

Auparavant, il leur faudra sauver le monde.